Pubmed XML: validar demais elementos obrigatórios de Journal (PublisherName, JournalTitle, Issn) + warning para opcionais incompletos

[Rossi-Luciano]

Contexto

A #1250 corrigiu o tratamento de Journal/PubDate ausente (obrigatório pela DTD do PubMed), mas a revisão da @robertatakenaka em #1250 apontou um problema mais amplo: esse tratamento não deveria ser exclusivo de PubDate.

Conferindo o DTD oficial (https://dtd.nlm.nih.gov/ncbi/pubmed/in/PubMed.dtd):

<!ELEMENT Journal (PublisherName, JournalTitle, Issn, Volume?, Issue?, PubDate)>

Ou seja, quatro elementos são obrigatórios dentro de Journal (sem ?): PublisherName, JournalTitle, Issn e PubDate. Só PubDate recebeu tratamento até agora (MissingRequiredElementError, movido para dentro de xml_pubmed_pub_date_pipe em #1250/#1234). xml_pubmed_publisher_name_pipe, xml_pubmed_journal_title_pipe e xml_pubmed_issn_pipe continuam gerando <Journal> silenciosamente inválido pelo DTD quando o dado de origem não existe.

Subtarefas

• Aplicar o mesmo padrão de xml_pubmed_pub_date_pipe (raise MissingRequiredElementError("Journal/PublisherName"), etc.) em xml_pubmed_publisher_name_pipe, xml_pubmed_journal_title_pipe e xml_pubmed_issn_pipe.
• Corrigir xml_pubmed_issn_pipe: a condição atual é if issn != "":, que não trata issn is None corretamente (deveria ser if not issn: para o caso obrigatório).
• Adicionar um mecanismo de WARNING (não exceção) para elementos opcionais que, uma vez presentes, têm sub-requisitos e estão incompletos — ex.: já existe um caso assim resolvido silenciosamente em Author (FirstName/LastName sempre em par, ver feat(pubmed): adicionar Suffix e CollectiveName em AuthorList #1245), que hoje duplica o nome disponível sem avisar.
• Decidir e documentar onde esse warning é emitido/reportado (a CLI em lote de Pubmed XML: CLI em lote (.zip) e registro como comando instalável #1241 já tem um caminho de warning por artigo que pode ser reaproveitado).

Origem

Levantado pela @robertatakenaka em revisão de código: #1250 (comment)